蛋白質(zhì)的空間結構是結構生物學的關鍵研究對象,其對于理解蛋白質(zhì)功能以及相關生物學過程的工作機理有非常重要的意義。準確的蛋白質(zhì)結構原子模型不僅能夠幫助研究者在理論上理解生命活動的內(nèi)在原理,同時也能為藥物研發(fā)等諸多工程實踐提供指導。
枚舉每一種蛋白質(zhì)可能存在的結構,需要花費大量的時間。最近,在強大的算法與算力的支持下,DeepMind將運算時間從數(shù)月縮短至了數(shù)小時。AI生物學帶來了極致的效率革命,這對于人類攻克癌癥等疑難雜癥有著劃時代的意義。要在數(shù)據(jù)洪流的時代實現(xiàn)重大的科學突破、分析基因組數(shù)據(jù),應用于藥物研發(fā)、疾病檢測、個性化治療,依賴于高效便捷的大數(shù)據(jù)分析技術和強大的計算平臺支持。蛋白質(zhì)破解的事件是一個標志,在生命科學領域取得突破性進展還需要高效的HPC系統(tǒng)和強大的算力,分析計算復雜、散點化、非結構化的生物醫(yī)學大數(shù)據(jù)。
本次大賽基于阿里云彈性高性能計算(Elastic High Performance Computing,E-HPC)進行。阿里云E-HPC平臺,基于阿里云基礎設施,可靈活生產(chǎn)基于任何ECS實例構成的HPC集群,滿足不同應用特征的性價比要求。阿里云E-HPC主要面向教育科研、企事業(yè)單位和個人,提供快捷、彈性、安全的一站式公共云HPC服務。計算實例基于intel第三代至強可擴展處理器(CooperLake),通過高效、面向未來的服務器基礎設施提供卓越的性能和靈活性,推動新的業(yè)務突破和科學發(fā)現(xiàn)。深度學習加速和增強型AVX-512等內(nèi)置優(yōu)勢提供了人工智能和HPC的融合以及工作負載性能。同時運用基于IceLake的Software Guard Expressions技術,通過內(nèi)存中獨立于操作系統(tǒng)或硬件配置的應用程序隔斷,提供細粒度的數(shù)據(jù)保護。
本次大賽意在探索基于大數(shù)據(jù)訓練的人工智能方法在由電勢能分布獲取蛋白質(zhì)原子模型方面的潛力,為未來云計算和生命科學領域的人才儲備。
